Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap25P60879 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms