Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp25P57080 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp25P57080 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp25P57080 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp25P57080 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp25P57080 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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