Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmoP56726 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmoP56726 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmoP56726 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmoP56726 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmoP56726 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmoP56726 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SmoP56726 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmoP56726 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmoP56726 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmoP56726 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmoP56726 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmoP56726 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmoP56726 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmoP56726 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmoP56726 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SmoP56726 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SmoP56726 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SmoP56726 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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