Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp9P49962 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms