Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnni3P48787 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnni3P48787 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnni3P48787 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnni3P48787 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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