Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brca1P48754 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brca1P48754 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brca1P48754 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brca1P48754 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brca1P48754 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brca1P48754 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brca1P48754 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brca1P48754 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brca1P48754 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms