Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GdnfP48540 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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