Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Epb41P48193 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Epb41P48193 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms