Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtgfrP43117 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms