Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgclP38060 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgclP38060 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgclP38060 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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