Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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