Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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