Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa3P28310 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa3P28310 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms