Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BrafP28028 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BrafP28028 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BrafP28028 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BrafP28028 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BrafP28028 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BrafP28028 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BrafP28028 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms