Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LynP25911 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LynP25911 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LynP25911 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LynP25911 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LynP25911 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LynP25911 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LynP25911 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LynP25911 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LynP25911 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms