Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Znf239P24399 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Znf239P24399 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Znf239P24399 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Znf239P24399 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Znf239P24399 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Znf239P24399 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Znf239P24399 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf239P24399 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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