Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RarbP22605 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RarbP22605 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RarbP22605 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RarbP22605 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RarbP22605 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RarbP22605 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RarbP22605 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RarbP22605 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms