Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm3P21107 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms