Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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