Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxb1P17919 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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