Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna1P16388 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms