Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms