Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms