Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC8.84□□□□□ -1
Vpreb1P13372 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC8.84□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms