Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl2P10148 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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