Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf1P09925 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Surf1P09925 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms