Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxd3P09027 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd3P09027 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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