Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Me1P06801 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Me1P06801 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Me1P06801 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Me1P06801 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Me1P06801 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Me1P06801 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Me1P06801 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Me1P06801 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Me1P06801 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Me1P06801 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Me1P06801 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Me1P06801 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Me1P06801 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms