Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp8O70404 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms