Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timm44O35857 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timm44O35857 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Timm44O35857 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms