Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx1aO35526 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1aO35526 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms