Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Clk2O35491 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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