Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcc1O35379 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcc1O35379 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcc1O35379 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcc1O35379 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcc1O35379 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcc1O35379 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcc1O35379 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcc1O35379 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcc1O35379 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcc1O35379 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Abcc1O35379 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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