Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dgcr6O35347 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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