Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kpna4O35343 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms