Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm8298J3QPI0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm8298J3QPI0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm8298J3QPI0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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