Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn34c3J3QJW5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn34c3J3QJW5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn34c3J3QJW5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn34c3J3QJW5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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