Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm20830J3KML6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20830J3KML6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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