Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20828J3KMI7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms