Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sclt1G5E861 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms