Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r167G3UW71 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r167G3UW71 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms