Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Igkv1-99F6XWB2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Igkv1-99F6XWB2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms