Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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