Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms