Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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Myo5cE9Q1F5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Myo5cE9Q1F5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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