Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn24D3YXJ9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn24D3YXJ9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms