Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms