Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms