Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clrn2B2RVW2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms