Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud7bB2RUR8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud7bB2RUR8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms